Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms