Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN18Q96SJ8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms