Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPS6KC1Q96S38 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms