Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPRD1AQ96P16 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms