Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN23Q96B33 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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