Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NEIL2Q969S2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NEIL2Q969S2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms