Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms