Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COPS9Q8WXC6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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