Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms