Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms