Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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