Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKL3Q8IVW4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKL3Q8IVW4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms