Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PBRM1Q86U86 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBRM1Q86U86 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms