Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VIRMAQ69YN4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VIRMAQ69YN4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms