Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms