Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDLRAP1Q5SW96 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms