Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms