Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BRMS1LQ5PSV4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms