Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms