Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL38Q2WGJ6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms