Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC57Q2TAC2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms