Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC27Q2M243 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms