Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms