Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRNQ16849 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms