Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms