Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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