Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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