Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZIC1Q15915 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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