Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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VPS72Q15906 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPS72Q15906 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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