Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms