Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms