Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms