Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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