Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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