Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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