Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR5A1Q13285 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR5A1Q13285 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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