Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TWF1Q12792 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TWF1Q12792 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TWF1Q12792 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TWF1Q12792 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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