Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms