Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms