Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms