Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms