Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms