Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DEFA6Q01524 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms