Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms