Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIM1P81133 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms