Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAP25P60880 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms