Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LOXL3P58215 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms