Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP107P57740 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms