Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GEMP55040 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GEMP55040 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GEMP55040 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms