Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMSP52788 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMSP52788 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms